本會設董事十五人組成董事會管理之,董事會職權如下:
一、基金會之籌集,管理及運用。
二、業務計畫之制訂及推行。
三、內部組織之制定及管理。
四、獎助案件的處理與有關辦法之訂定。
五、年度收支預算及決算之審定。
六、董事之改選(聘)。
七、其他重要事項之處理。
本會由董事長綜理會務,指揮所屬員工及事業機構,處理經常性業務,並設祕書處,置執行長及秘書各一人,內分下列三組分掌各項業務。
一、業務組。
二、財務組。
三、行政組。
執行長承董事長之命,策訂年度工作計畫並督導所屬員工,推動會務,其職掌如下:
一、執行本會捐助及組織章程第二條規定之目的事業。
二、執行董事會決議事項。
三、業務發展研究及業務考核改進事項。
四、所屬員工之考核獎懲事項。
五、各單位之聯繫事項。
秘書襄助執行長處理會務並協調各單位會簽文書及會計憑證之審核簽轉。負責本會文獻資料彙集編輯工作。
業務組
一、年度事業計畫之釐訂及事業報告事項。
二、辦理有關農業新知之學術研究及推廣教育活動事項。
三、辦理有關農村青年技能教育及資優農村子弟之培育輔導事項。
四、辦理國際文教交流活動事項。
五、辦理台北市立瑠公國中在校生及畢業後繼續升學、就讀國內各級學校(含研究所)之獎助事項。
六、辦理台北市瑠公農田水利會會員及員工之在學學子獎(助)學金事項。
七、辦理台北市政府所屬各級學校師生在學術、文化、教育等各項競賽活動有特殊傑出事蹟之獎助事項。
八、辦理親職教育、兩性教育及青少年問題諮詢及輔導工作。
九、推展青少年德、智、體、群、美五育活動。
十、辦理母語及多國語言教育工作。
十一、配合政府辦理教育改革事項。
十二、辦理有關在校學生偶發事件亟待支助事項。
財務組
一、基金及運用經費之管理與調度事項。
二、財產之管理、登記事項。
三、年度預、決算及會計、審計事項。
四、財務憑證、帳冊、檔案管理及資料彙集、統計分析、編撰報告事項。
行政組
一、圖記、圖書檔案管理事項。
二、人事管理及有關健保、勞保工作事項。
三、事務管理及出納工作事項。
四、辦理董事改選事項。
五、上級交辦事項。
為推動會務,各組置組長一人,研究員、研究助理、佐理員、辦事員、服務員各若干人,其編制員額,由董事長視工作需要及財務狀況核定之並列入年度計畫,提報董事會同意。